liu.seSök publikationer i DiVA
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • oxford
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Efficient prediction of human protein-protein interactions at a global scale
Carleton University, Ottawa, Canada.
Carleton University, Ottawa, Canada.
Carleton University, Ottawa, Canada.
Carleton University, Ottawa, Canada.
Visa övriga samt affilieringar
2014 (Engelska)Ingår i: BMC bioinformatics, ISSN 1471-2105, Vol. 15, nr 1, s. 383-Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

BackgroundOur knowledge of global protein-protein interaction (PPI) networks in complex organisms such as humans is hindered by technical limitations of current methods.ResultsOn the basis of short co-occurring polypeptide regions, we developed a tool called MP-PIPE capable of predicting a global human PPI network within 3 months. With a recall of 23% at a precision of 82.1%, we predicted 172,132 putative PPIs. We demonstrate the usefulness of these predictions through a range of experiments.ConclusionsThe speed and accuracy associated with MP-PIPE can make this a potential tool to study individual human PPI networks (from genomic sequences alone) for personalized medicine.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
BioMed Central, 2014. Vol. 15, nr 1, s. 383-
Nationell ämneskategori
Klinisk medicin
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:liu:diva-114135DOI: 10.1186/s12859-014-0383-1ISI: 000347647900001PubMedID: 25492630OAI: oai:DiVA.org:liu-114135DiVA, id: diva2:787556
Tillgänglig från: 2015-02-10 Skapad: 2015-02-10 Senast uppdaterad: 2015-04-10Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(1419 kB)218 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 1419 kBChecksumma SHA-512
cc2546bb4df04ee811c390fc9841f5c6c1d5367c4672f5d2a20c51ac709f57c6fd304f9dc0f6fe9955462a7740079d120644c9827eddf22761fc54a64dbbdf29
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMed

Personposter BETA

Wang, HuiBarrenäs, FredrikBenson, Mikael

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Wang, HuiBarrenäs, FredrikBenson, Mikael
Av organisationen
Avdelningen för kliniska vetenskaperHälsouniversitetetAllergicentrum USBarn- och ungdomskliniken i Linköping
Klinisk medicin

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 218 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 275 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • oxford
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf