liu.seSök publikationer i DiVA
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • harvard1
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • oxford
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Steric Effects Govern the Photoactivation of Phytochromes
Linköpings universitet, Institutionen för fysik, kemi och biologi, Teoretisk kemi. Linköpings universitet, Tekniska fakulteten.
Linköpings universitet, Institutionen för fysik, kemi och biologi, Teoretisk kemi. Linköpings universitet, Tekniska fakulteten.
2016 (Engelska)Ingår i: ChemPhysChem, ISSN 1439-4235, E-ISSN 1439-7641, Vol. 17, nr 7, s. 954-957Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Resurstyp
Text
Abstract [en]

Phytochromes constitute a superfamily of photoreceptor proteins existing in two forms that absorb red (Pr) and far-red (Pfr) light. Although it is well-known that the conversion of Pr into Pfr (the biologically active form) is triggered by a ZE photoisomerization of the linear tetrapyrrole chromophore, direct evidence is scarce as to why this reaction always occurs at the methine bridge between pyrrole rings C and D. Here, we present hybrid quantum mechanics/molecular mechanics calculations based on a high-resolution Pr crystal structure of Deinococcus radiodurans bacteriophytochrome to investigate the competition between all possible photoisomerizations at the three different (AB, BC and CD) methine bridges. The results demonstrate that steric interactions with the protein are a key discriminator between the different reaction channels. In particular, it is found that such interactions render photoisomerizations at the AB and BC bridges much less probable than photoisomerization at the CD bridge.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
WILEY-V C H VERLAG GMBH , 2016. Vol. 17, nr 7, s. 954-957
Nyckelord [en]
chromophores; isomerization; photoreceptor proteins; QM; MM modeling; range-separated functionals
Nationell ämneskategori
Kemi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:liu:diva-127554DOI: 10.1002/cphc.201501080ISI: 000373738200002PubMedID: 26756452OAI: oai:DiVA.org:liu-127554DiVA, id: diva2:926194
Anmärkning

Funding Agencies|Linkoping University; Swedish Research Council [621-2011-4353]; Olle Engkvist Foundation

Tillgänglig från: 2016-05-04 Skapad: 2016-05-03 Senast uppdaterad: 2017-11-30

Open Access i DiVA

fulltext(495 kB)117 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 495 kBChecksumma SHA-512
5112f40f9024ae5234006cbb59f90cf293f7dac17055203fe3d28684dc1a6003c5ca37acd301107682b053dabe2aefa82e8dc58cfde408f62ac110f7de6e3abc
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMed

Personposter BETA

Falklöf, OlleDurbeej, Bo

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Falklöf, OlleDurbeej, Bo
Av organisationen
Teoretisk kemiTekniska fakulteten
I samma tidskrift
ChemPhysChem
Kemi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 117 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 228 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • harvard1
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • oxford
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf