liu.seSök publikationer i DiVA
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • harvard1
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • oxford
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Drug combinatorics and side effect estimation on the signed human drug-target network
University of Politecn Cataluna, Spain.
Linköpings universitet, Institutionen för systemteknik, Reglerteknik. Linköpings universitet, Tekniska fakulteten.ORCID-id: 0000-0003-4142-6502
2016 (Engelska)Ingår i: BMC Systems Biology, ISSN 1752-0509, E-ISSN 1752-0509, Vol. 10, nr 74Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Background: The mode of action of a drug on its targets can often be classified as being positive (activator, potentiator, agonist, etc.) or negative (inhibitor, blocker, antagonist, etc.). The signed edges of a drug-target network can be used to investigate the combined mechanisms of action of multiple drugs on the ensemble of common targets. Results: In this paper it is shown that for the signed human drug-target network the majority of drug pairs tend to have synergistic effects on the common targets, i.e., drug pairs tend to have modes of action with the same sign on most of the shared targets, especially for the principal pharmacological targets of a drug. Methods are proposed to compute this synergism, as well as to estimate the influence of the drugs on the side effect of another drug. Conclusions: Enriching a drug-target network with information of functional nature like the sign of the interactions allows to explore in a systematic way a series of network properties of key importance in the context of computational drug combinatorics.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
BIOMED CENTRAL LTD , 2016. Vol. 10, nr 74
Nationell ämneskategori
Bioinformatik (beräkningsbiologi)
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:liu:diva-131906DOI: 10.1186/s12918-016-0326-8ISI: 000383020500001PubMedID: 27526853OAI: oai:DiVA.org:liu-131906DiVA, id: diva2:1034863
Anmärkning

Funding Agencies|Swedish Research Council [2015-04390]

Tillgänglig från: 2016-10-13 Skapad: 2016-10-11 Senast uppdaterad: 2018-01-14

Open Access i DiVA

fulltext(1509 kB)79 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 1509 kBChecksumma SHA-512
a53a7a8ebcc55dd6036d83d986c1fd23780274a47f4ce6ee3d4545fcf3e2707be891051e05c82f456ffc1a94f6730fa9da4121dbd6754b780aa1f4aff5857219
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMed

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Altafini, Claudio
Av organisationen
ReglerteknikTekniska fakulteten
I samma tidskrift
BMC Systems Biology
Bioinformatik (beräkningsbiologi)

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 79 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 571 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • harvard1
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • oxford
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf