liu.seSök publikationer i DiVA
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • harvard1
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • oxford
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Reply to BROWN AND BEHRMANN, COX ET AL., AND KESSLER ET AL.: Data and code sharing is the way forward for fMRI
Linköpings universitet, Institutionen för medicinsk teknik, Avdelningen för medicinsk teknik. Linköpings universitet, Institutionen för datavetenskap, Statistik. Linköpings universitet, Tekniska fakulteten. Linköpings universitet, Centrum för medicinsk bildvetenskap och visualisering, CMIV.
Department of Statistics, University of Warwick, UK; WMG, University of Warwick, UK.
Linköpings universitet, Institutionen för medicinsk teknik, Avdelningen för medicinsk teknik. Linköpings universitet, Tekniska fakulteten. Linköpings universitet, Centrum för medicinsk bildvetenskap och visualisering, CMIV.ORCID-id: 0000-0002-9091-4724
2017 (Engelska)Ingår i: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, ISSN 0027-8424, E-ISSN 1091-6490, s. 1-2Artikel i tidskrift, Letter (Övrigt vetenskapligt) Published
Abstract [en]

We are glad that our paper (1) has generated intense discussions in the fMRI field (2⇓–4), on how to analyze fMRI data, and how to correct for multiple comparisons. The goal of the paper was not to disparage any specific fMRI software, but to point out that parametric statistical methods are based on a number of assumptions that are not always valid for fMRI data, and that nonparametric statistical methods (5) are a good alternative. Through AFNI’s introduction of nonparametric statistics in the function 3dttest++ (3, 6), the three most common fMRI softwares now all support nonparametric group inference [SPM through the toolbox SnPM (www2.warwick.ac.uk/fac/sci/statistics/staff/academic-research/nichols/software/snpm), and FSL through the function randomise].

Cox et al. (3) correctly point out that the bug in the AFNI function 3dClustSim only had a minor impact on the false-positive rate (FPR). This was also covered in our original paper (1): “We note that FWE [familywise error] rates are lower with the bug-fixed 3dClustSim function. As an example, the updated function reduces the degree of false …

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2017. s. 1-2
Nationell ämneskategori
Medicinteknik
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:liu:diva-136541DOI: 10.1073/pnas.1620285114OAI: oai:DiVA.org:liu-136541DiVA, id: diva2:1089371
Tillgänglig från: 2017-04-19 Skapad: 2017-04-19 Senast uppdaterad: 2019-07-04Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

Reply to BROWN AND BEHRMANN, COX ET AL., AND KESSLER ET AL.: Data and code sharing is the way forward for fMRI(504 kB)96 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 504 kBChecksumma SHA-512
822d016ebc35328f30ac0e8faf0c454685516a4048ef0d0bcc48afe0979183d282ad8b55be66e4d6891a84da88f6dd8e4d12dcf13a3e73bfc64e70ccf0dd1c37
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltext

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Eklund, AndersKnutsson, Hans
Av organisationen
Avdelningen för medicinsk teknikStatistikTekniska fakultetenCentrum för medicinsk bildvetenskap och visualisering, CMIV
I samma tidskrift
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
Medicinteknik

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 96 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
urn-nbn
Totalt: 476 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • harvard1
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • oxford
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf