liu.seSök publikationer i DiVA
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • oxford
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Interactive Visualization of 3D Histopathology in Native Resolution
Linköpings universitet, Institutionen för teknik och naturvetenskap, Medie- och Informationsteknik. Linköpings universitet, Tekniska fakulteten. (Scientific Visualization Group)ORCID-id: 0000-0003-1511-5006
Linköpings universitet, Institutionen för teknik och naturvetenskap, Medie- och Informationsteknik. Linköpings universitet, Tekniska fakulteten. (Scientific Visualization Group)ORCID-id: 0000-0002-9466-9826
Linköpings universitet, Centrum för medicinsk bildvetenskap och visualisering, CMIV. Leeds Teaching Hospitals NHS Trust, United Kingdom.
Linköpings universitet, Centrum för medicinsk bildvetenskap och visualisering, CMIV. Sectra, Linköping, Sweden.ORCID-id: 0000-0002-9368-0177
2019 (Engelska)Ingår i: IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics, ISSN 1077-2626, E-ISSN 1941-0506, Vol. 25, nr 1, s. 1008-1017Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

We present a visualization application that enables effective interactive visual analysis of large-scale 3D histopathology, that is, high-resolution 3D microscopy data of human tissue. Clinical work flows and research based on pathology have, until now, largely been dominated by 2D imaging. As we will show in the paper, studying volumetric histology data will open up novel and useful opportunities for both research and clinical practice. Our starting point is the current lack of appropriate visualization tools in histopathology, which has been a limiting factor in the uptake of digital pathology. Visualization of 3D histology data does pose difficult challenges in several aspects. The full-color datasets are dense and large in scale, on the order of 100,000 x 100,000 x 100 voxels. This entails serious demands on both rendering performance and user experience design. Despite this, our developed application supports interactive study of 3D histology datasets at native resolution. Our application is based on tailoring and tuning of existing methods, system integration work, as well as a careful study of domain specific demands emanating from a close participatory design process with domain experts as team members. Results from a user evaluation employing the tool demonstrate a strong agreement among the 14 participating pathologists that 3D histopathology will be a valuable and enabling tool for their work.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2019. Vol. 25, nr 1, s. 1008-1017
Nyckelord [en]
Histology, Pathology, Volume Rendering, Expert Evaluation
Nationell ämneskategori
Datavetenskap (datalogi)
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:liu:diva-150420DOI: 10.1109/tvcg.2018.2864816ISI: 000452640000096OAI: oai:DiVA.org:liu-150420DiVA, id: diva2:1240806
Forskningsfinansiär
VINNOVA, 2014-04257
Anmärkning

Funding agencies: Excellence Center at Linkoping and Lund in Information Technology (ELLIIT); Swedish e-Science Research Centre (SeRC); DigiPat project by VINNOVA grant [2014-04257]

Tillgänglig från: 2018-08-22 Skapad: 2018-08-22 Senast uppdaterad: 2019-01-07

Open Access i DiVA

fulltext(8509 kB)1693 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT02.pdfFilstorlek 8509 kBChecksumma SHA-512
3edc86ada1a0b1aa35c888adb19e31ddd4f43653b40c57dc5de4fded8d55e6539d3ac240584090c1d513b10871401676f7232aa8e32523bc285f916005935d78
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltext

Person

Falk, MartinYnnerman, AndersTreanor, DarrenLundström, Claes

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Falk, MartinYnnerman, AndersTreanor, DarrenLundström, Claes
Av organisationen
Medie- och InformationsteknikTekniska fakultetenCentrum för medicinsk bildvetenskap och visualisering, CMIV
I samma tidskrift
IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics
Datavetenskap (datalogi)

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 1693 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
urn-nbn
Totalt: 7082 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • oxford
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf