liu.seSök publikationer i DiVA
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • oxford
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Interactive Analytics and Visualization for Data Driven Calculation of Individualized COPD Risk
Linköpings universitet, Institutionen för datavetenskap, Interaktiva och kognitiva system.
2018 (Engelska)Självständigt arbete på avancerad nivå (masterexamen), 20 poäng / 30 hpStudentuppsats (Examensarbete)
Abstract [en]

Chronic obstructive pulmonary disease (COPD) is a high mortality disease, second to stroke and ischemic heart disease. This non-curable disease progressively exacerbates, leading to high personal and societal economic impact, reduced quality of life and often death. General treatment plans for COPD risk mistreating the individuals’ condition. To be effective, the treatment should be individualized following the practices of precision medicine. The aim of this thesis was to develop a data driven algorithm and system with visualization to assess individual COPD risk. With MRI body composition profile measurements, it is possible to accurately assess propensity of a multitude of metabolic conditions, such as coronary heart disease and type 2 diabetes.  The algorithm and system has been developed using Wolfram Language and R within the Wolfram Mathematica framework. The algorithm calculates individualized virtual control groups metabolically similar to the patient’s body composition and spirometric profile. Using UK Biobank data, our tool was used to assess patient COPD propensity using an individual-specific virtual control group with AUROC 0.778 (female) and 0.758 (men). Additionally, the tool was used to identify new body composition profiles related to COPD and associated comorbid conditions.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2018. , s. 87
Nyckelord [en]
COPD, Visualization, Big Data, Virtual Control Group
Nationell ämneskategori
Läkemedelsbioteknik Människa-datorinteraktion (interaktionsdesign)
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:liu:diva-151925ISRN: LIU-IDA/LITH-EX-A--18/026--SEOAI: oai:DiVA.org:liu-151925DiVA, id: diva2:1254802
Externt samarbete
AMRA Medical; Wolfram Mathcore
Ämne / kurs
Teknisk biologi
Presentation
2018-06-13, Alan Turing, Linköping, 11:11 (Svenska)
Handledare
Examinatorer
Tillgänglig från: 2018-10-11 Skapad: 2018-10-10 Senast uppdaterad: 2018-10-11Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

Interactive Visualization COPD Emil Arkstål(5229 kB)450 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 5229 kBChecksumma SHA-512
d444dbf08713df7ec9ca0cf2a92830eee179ab75293740e2cfcd089672035286aa4c9b8393cb1cb0cd474230d57efea7007249effd270ceca5661d48dbf6da83
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Arkstål, Emil
Av organisationen
Interaktiva och kognitiva system
LäkemedelsbioteknikMänniska-datorinteraktion (interaktionsdesign)

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 460 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

urn-nbn

Altmetricpoäng

urn-nbn
Totalt: 1034 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • oxford
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf