liu.seSök publikationer i DiVA
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • oxford
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
A ranking index for quality assessment of forensic DNA profiles
Lunds Universitet/Lunds Tekniska Högskola.
Linköpings universitet, Institutionen för fysik, kemi och biologi, Molekylär genetik. Linköpings universitet, Tekniska högskolan.
Linköpings universitet, Institutionen för datavetenskap, Statistik. Linköpings universitet, Filosofiska fakulteten.
2010 (Engelska)Ingår i: BMC Research Notes, ISSN 1756-0500, Vol. 3, nr 290Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Background

Assessment of DNA profile quality is vital in forensic DNA analysis, both in order to determine the evidentiary value of DNA results and to compare the performance of different DNA analysis protocols. Generally the quality assessment is performed through manual examination of the DNA profiles based on empirical knowledge, or by comparing the intensities (allelic peak heights) of the capillary electrophoresis electropherograms.

Results

We recently developed a ranking index for unbiased and quantitative quality assessment of forensic DNA profiles, the forensic DNA profile index (FI) (Hedman et al. Improved forensic DNA analysis through the use of alternative DNA polymerases and statistical modeling of DNA profiles, Biotechniques 47 (2009) 951-958). FI uses electropherogram data to combine the intensities of the allelic peaks with the balances within and between loci, using Principal Components Analysis. Here we present the construction of FI. We explain the mathematical and statistical methodologies used and present details about the applied data reduction method. Thereby we show how to adapt the ranking index for any Short Tandem Repeat-based forensic DNA typing system through validation against a manual grading scale and calibration against a specific set of DNA profiles.

Conclusions

The developed tool provides unbiased quality assessment of forensic DNA profiles. It can be applied for any DNA profiling system based on Short Tandem Repeat markers. Apart from crime related DNA analysis, FI can therefore be used as a quality tool in paternal or familial testing as well as in disaster victim identification.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
BioMed Central Ltd , 2010. Vol. 3, nr 290
Nationell ämneskategori
Bioinformatik (beräkningsbiologi) Biokemi och molekylärbiologi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:liu:diva-67997DOI: 10.1186/1756-0500-3-290OAI: oai:DiVA.org:liu-67997DiVA, id: diva2:414894
Tillgänglig från: 2011-05-05 Skapad: 2011-05-04 Senast uppdaterad: 2018-01-12

Open Access i DiVA

fulltext(1436 kB)159 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 1436 kBChecksumma SHA-512
7c21a8bb64d16d210258ac47ad6b650280bc7fa700dee6daba28d4b329bf375cc823d0dfe5f382e8457d87570f383920514bedce022e82e6ed31a41ab9cc7326
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltexthttp://www.biomedcentral.com/1756-0500/3/290

Personposter BETA

Ansell, RickyNordgaard, Anders

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Ansell, RickyNordgaard, Anders
Av organisationen
Molekylär genetikTekniska högskolanStatistikFilosofiska fakulteten
Bioinformatik (beräkningsbiologi)Biokemi och molekylärbiologi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 159 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
urn-nbn
Totalt: 289 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • oxford
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf