liu.seSearch for publications in DiVA
Change search
CiteExportLink to record
Permanent link

Direct link
Cite
Citation style
  • apa
  • harvard1
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • oxford
  • Other style
More styles
Language
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Other locale
More languages
Output format
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Produktion och karakterisering av bindningsegenskaperna hos rekombinanta former av Aleuria Aurantia lektin
Linköping University, Department of Physics, Chemistry and Biology. Linköping University, The Institute of Technology.
2014 (Swedish)Independent thesis Advanced level (degree of Master (Two Years)), 20 credits / 30 HE creditsStudent thesis
Abstract [sv]

Glykosyleringsförändringar har sedan länge associerats med sjukdomar. Det finns olika sätt att undersöka detta. Ett vanligt förekommande sätt är att använda lektiner som prob mot specifika glykanstrukturer. Detta kan exempelvis användas i en enzymkopplad lektinanalys eller ytplasmonresonansanalys. En specifik glykosyleringsförändring som blivit förknippad med olika sjukdomar är förhöjda nivåer av fukos på N-glykaner. För att undersöka dessa förändringar används vanligen det fukosbindande lektinet Aleuria aurantia (AAL) som kan binda till alla naturligt förekommande fukosyleringar. AAL består av en β-propellerstruktur som ger upphov till fem fukosbindande fickor.

Syftet med denna studie var att genom att mutera den monomera varianten av AAL (mAAL) undersöka bindningsegenskaperna hos de fem olika bindningsfickorna. För detta konstruerades sex nya konstrukt av mAAL, fem av dessa innehöll mutationer i alla utom en bindningsficka och en där samtliga bindningsfickor var muterade. Mutationernas syfte var att tillåta att en bindningsficka kunde studeras åt gången.

Resultatet visar att de punktmutationer i mAAL på aminosyrorna tyrosin/tryptofan, som binder fukos till fenylalanin inte kunde blockera bindningsfickorna som tänkt men däremot minska lektinets affinitet. Slutsatsen kring bindningsegenskaperna var att mAAL och samtliga mutationsvarianter av mAAL visade högre affinitet mot korta och icke sialylerade oligosackarider och att bindningsficka II möjligen kan ha mycket högre affinitet än de övriga bindningsfickorna.

Abstract [en]

Glycosylation changes have long been associated with different diseases. There is a number of ways to analyze these changes. A common way is to use lectins as a probe for specific glycan structure. This can be used in an enzyme linked lectin assay or a surface plasmon resonance analysis. A specific glycosylation change which has been associated with various diseases is elevated levels of fukos on N-glycans. To analyze these changes Aleuria aurantia lectin (AAL) is usually used. It is a lectin which can bind to all naturally occurring fucosylations. AAL consists of a β-propeller structure that gives rise to five fucose binding pockets.

The purpose of this study was to examine the binding characteristics of the five different binding pockets by mutating the monomeric form of AAL (mAAL).  To study the binding sites one at a time, six new constructs were made, five constructs with mutations in all binding sites except one and one construct with all binding sites mutated.  

The result shows that the point specific mutations in mAAL on tyrosine/tryptophan, that binds fucose in each binding site, to phenylalanine did not block the binding pockets but reduced the affinity. The conclusion made about the binding characteristics is that mAAL and all new constructs of mAAL have higher affinity towards short and non sialylated oligosaccharides and that the binding pocket II may possibly have much higher affinity than the other binding pockets.

Place, publisher, year, edition, pages
2014. , 43 p.
Keyword [sv]
Lektin, Aleuria Aurantia Lektin, cancerdiagnostik, glykan, punktmutation
National Category
Engineering and Technology Natural Sciences
Identifiers
URN: urn:nbn:se:liu:diva-106596ISRN: LITH-IFM-A-Ex-14/2908--SEOAI: oai:DiVA.org:liu-106596DiVA: diva2:716898
Subject / course
Biochemistry
Presentation
(Swedish)
Supervisors
Examiners
Available from: 2014-05-13 Created: 2014-05-13 Last updated: 2014-05-13Bibliographically approved

Open Access in DiVA

No full text

Search in DiVA

By author/editor
Jansson, Joe
By organisation
Department of Physics, Chemistry and BiologyThe Institute of Technology
Engineering and TechnologyNatural Sciences

Search outside of DiVA

GoogleGoogle Scholar

urn-nbn

Altmetric score

urn-nbn
Total: 109 hits
CiteExportLink to record
Permanent link

Direct link
Cite
Citation style
  • apa
  • harvard1
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • oxford
  • Other style
More styles
Language
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Other locale
More languages
Output format
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf