liu.seSök publikationer i DiVA
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • oxford
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Revisiting Salerno's sine-Gordon model of DNA: Active regions and robustness
Linköpings universitet, Tekniska högskolan. Linköpings universitet, Institutionen för fysik, kemi och biologi.
Linköpings universitet, Tekniska högskolan. Linköpings universitet, Institutionen för teknik och naturvetenskap.ORCID-id: 0000-0003-0528-9782
2003 (Engelska)Ingår i: Physica D: Non-linear phenomena, ISSN 0167-2789, E-ISSN 1872-8022, Vol. 177, nr 1-4, s. 233-241Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

We return to a simple model of DNA-transcription, first investigated by Salerno more than 10 years ago. One conjecture that time was that the promoter-regions were "dynamically active" in the sense that a stationary kink solution to the discrete sine-Gordon equation spontaneously starts to move when positioned in certain regions. Here we explore the whole genome of the bacteriophage T7, which is the same that was used in the first studies. We find that the regions in the promoters where the DNA-binding molecules attach have no special significance, while the start of the RNA-coding regions are dynamically active on a significant level. The results are checked to be robust by imposing an external disturbance in the form of a thermostat, simulating a constant temperature. © 2002 Elsevier Science B.V. All rights reserved.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2003. Vol. 177, nr 1-4, s. 233-241
Nyckelord [en]
DNA, Genome-wide, Promoters, Robustness, Sine-Gordon
Nationell ämneskategori
Teknik och teknologier
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:liu:diva-46698DOI: 10.1016/S0167-2789(02)00769-8OAI: oai:DiVA.org:liu-46698DiVA, id: diva2:267594
Tillgänglig från: 2009-10-11 Skapad: 2009-10-11 Senast uppdaterad: 2017-12-13

Open Access i DiVA

Fulltext saknas i DiVA

Övriga länkar

Förlagets fulltext

Person

Lennholm, ErikHörnquist, Michael

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Lennholm, ErikHörnquist, Michael
Av organisationen
Tekniska högskolanInstitutionen för fysik, kemi och biologiInstitutionen för teknik och naturvetenskap
I samma tidskrift
Physica D: Non-linear phenomena
Teknik och teknologier

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar

doi
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
urn-nbn
Totalt: 452 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • oxford
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf